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Si ces 2 opérations ont pour point commun de s’effectuer électroniquement, le processus n’est pas le même ni techniquement, ni administrativement sur un webshop ou dans un magasin physique qui dispose d’un terminal de paiement au comptoir.
Les commissions sur internet sont significativement plus importantes (réduisant donc un peu les marges en comparaison avec une vente en comptoir).
Certains prestataires louant des terminaux physiques proposent un avenant au contrat, avec une tarification différenciée en fonction des transactions en ligne/en magasin. Il est néanmoins judicieux de faire son marché en consultant également des prestataires exclusivement spécialisés dans les paiements en ligne.