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Si ces deux opérations s’effectuent électroniquement, le processus technique et administratif d’un paiement en ligne sur un e-shop diffère de celui effectué dans un magasin physique via un terminal de paiement au comptoir.
Les commissions sur internet sont significativement plus importantes, réduisant donc un peu les marges en comparaison avec une vente en comptoir.
Certains prestataires louant des terminaux physiques proposent un avenant au contrat, avec une tarification différenciée en fonction des transactions en ligne/en magasin. Il est néanmoins judicieux de faire son marché en consultant également des prestataires exclusivement spécialisés dans les paiements en ligne.